Tumeurs solides :
– Le kit Oncomine™ Solid Tumor DNA Panel (92 amplicons) couvrant les gènes AKT1 , ALK , BRAF, CTNNB1, DDR2 , EGFR , ERBB2 ,ERBB4, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, KRAS, MAP2K1, MET, NOTCH1 , NRAS, PIK3CA, PTEN, SMAD4 , STK11 , TP53.
– Le kit Oncomine™ Solid Tumor PLUS DNA panel (26 amplicons) couvrant les gènes ALK, EGFR, ERBB4, FGFR2, HRAS, KIT, MET, PDGFRA.
Sensibilité analytique 5%.
– Le kit Oncomine™ Solid Tumour Fusion Transcript, pour la recherche de fusions des 4 gènes ALK, ROS-1, RET, et NTRK-1.
– Pour la recherche de mutations somatiques des gènes BRCA1 / BRCA2 :
La méthode d’analyse est la technique de séquençage nouvelle génération (Miseq, Illumina) couvrant les gènes BRA1, BRCA2 (Kit mini-HRS SOPHIA). Alignement, appel de variant et recherche de CNV sur SOPHIA-DDM (SOPHIA GENETICS).